معدل التطور النسبي

We are searching data for your request:

Forums and discussions:

Manuals and reference books:

Data from registers:

Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

من المفترض أن أحسب المعدل النسبي لتطور تسلسلين (بشري وخراف) مع دجاجة تعمل كمجموعة خارجية. التسلسلات طويلة جدًا ، لذا سأقوم فقط بإنشاء مثال قصير لأنني أريد فقط أن أتعلم العملية (من المتوقع أن نستخدم الموارد عبر الإنترنت لمعرفة مشاكل الواجبات المنزلية نظرًا لأنها فصل دراسي عبر الإنترنت ، لكن لا يمكنني العثور على أي منها أمثلة).

الإنسان: GGATGCGCCT
الأغنام: GGACGCGCCT
الدجاج: GGACACGCCT

هل يمكن لأحد أن يريني كيف أفعل هذا؟ هذا هو تخميني من المعلومات المحدودة التي وجدتها ، لكن لدي القليل من الثقة في أنها صحيحة:

المسافة ف بين الإنسان / الدجاج = 2
المسافة p من الأغنام / الدجاج = 1
معدل التطور النسبي = 2/1 = 2

هل هذا صحيح؟ إذا لم يكن الأمر كذلك ، فهل يمكن لأي شخص أن يوضح لي كيفية القيام بذلك بشكل صحيح؟

يتم حساب هذا النوع من الأشياء عادةً باستخدام نسبة $ K_ {a} / K_ {s} $ ، وهي نسبة الاستبدالات المرادفة إلى غير المترادفة. لا يكفي حساب الطفرات لتسلسلات الترميز ، بل يجب أيضًا أن تأخذ في الاعتبار ما إذا كانت هذه الطفرة ستغير المنتج الناتج بالفعل أم لا.

هناك العديد من الأدوات عبر الإنترنت التي يمكن أن تساعدك في القيام بذلك ، على سبيل المثال Phylemon:

http://phylemon.bioinfo.cipf.es/evolutionary.html